清眼僧都（せいげんそうず）というお坊さまは夢の中で異国人からある医書を示された。そうして手にした医書（おそらく中国の眼科書であったと思われる）をもとに、眼科を始めたのが、日本で最も古い歴史をもつ馬島流眼科であると言われ、以来、尾張国海東郡馬島村（現在の愛知県海部郡大治町）の医王山薬師寺・蔵南坊の住職は代々、眼科医として活躍した。１３代目にあたる慶法院は寛永９年（１６３２年）、後水尾天皇の息女、三の宮の眼病を治療し、「明眼院（みょうげんいん）」の寺号を賜った。天保の頃にはいくつもの病棟をもつほど、栄えたが、明治以降、僧職と医師の兼職が禁止となり、明眼院の診療所は閉鎖され寂れていったが、戦後、「明眼院」は現在の海部郡大治町に再興され、眼科発祥の地として注目を浴びた。

一方、明治以降、明眼院を後にした馬嶋流眼科を発症とする馬嶋家は、後世にその流れを継承し、現代の白内障手術の先駆者として知られる第３７代馬嶋慶直（藤田学園名古屋保健衛生大学学長）、３８代馬嶋清如（同眼科学教授）へと引き継がれ、優れた研究者、臨床医として活躍している。
当院は、その血縁筋である故馬嶋季彦により、戦後、地域に密着した医療を目指し、開業。長い馬嶋流眼科の歴史を背景に、常に時代に即した眼科医療機関として、いつの時代も変わらず患者様の立場に立った、人に寄り添う暖かい眼科でありたいと願っている。